Säsong 5 sändes från 29 juni 1998 till 8 februari 1999.

Lista över avsnitt

Följande är en lista över avsnitt för säsong 5.

Jpn #	Int #	Avsnittets titel	Originalutsändning	Engelsk dub-sändning	Komplott	Manga källa	Nästa Conans tips
107	113	The Mysterious Mole Alien Case (del 1)	29 juni 1998			TV Original	Smyckerövare
Medan hon spelar baseboll kastar Conan och Detective Boys av misstag bollen i någons trädgård. På vägen för att hämta det möter de Yoshikazu Watanuki, en man som visar sig vara misstänkt för ett mordfall.
108	114	The Mysterious Mole Alien Case (Part 2)	6 juli 1998			TV Original	Manhål
Polisen hittar Masao vid Yoshikazus hus som begravde de stulna juvelerna runt gården. Polisen tvingas gräva gården, men de hittar ingen kropp. Conan är positiv Yoshikazu dödade Masaos syster bara genom den smirret han har i ansiktet. Detektivpojkarna frågar ett vittne som hörde grävande ljud från Yoshikazus gård samma dag som Masaos syster försvann för att hitta att vittnet gjorde ett misstag och bullret kom faktiskt från byggarbetsplatsen intill. Conan ringer till polisen och håller på en show som berättar om hans avdrag. Conan påpekar att kroppen är under en växande blomma som groddes från offret som fick i gåva den dagen hon försvann.
109	115	Detective Club Pursuit Case	13 juli 1998			TV Original	Grumligt vatten
Ayumi träffas av en röd bil och de andra tre medlemmarna i klubben Detective Boys jagar efter den på Conans skateboard. De tappar det ur sikte nära en fabrik, men de hittar det igen några minuter senare att jaga det till en polisstation där en man som heter Kenichi Shishido visar sig för träff och spring. På sjukhuset är alla förvånade över att höra att en man har mördats i fabriken där de var. Conan hittar en röd bil i en byggnad bredvid fabriken och andra ledtrådar som pekar på mordet på Kenichi. Conan slår ut Kogoro för att förklara att Kenichi är mördaren och han slog medvetet Ayumi och tillät Detective Boys att jaga honom som en alibi. Som bevis finner de Ayumis detektivmärke fast mellan bilens stötfångare i garaget.
110	116	Cooking Classroom Murder Case (del 1)	27 juli 1998			TV Original	Is
Ran tar en fransk matlagningskurs i Sonokos frånvaro och Conan och Kogoro följer med. Det finns en mörkläggning medan Conan och Kogoro går till tvättrummet och de hittar någon medvetet snubblat av strömbrytaren med en vikt och ett isblock. När han återvände till köket står läraren på golvet och hävdar att han har andningssvårigheter och Conan upptäcker att hon har punkterats i ryggen. Polisen undersöker och hittar bevis angriparen var någon inifrån.
111	117	Cooking Classroom Murder Case (del 2)	3 augusti 1998			TV Original	Ringa
De fyra misstänkta förhörs och genomsöks. Det verkar som om alla har ett motiv, men inga bevis eller mordvapen hittas för att hitta mördaren. Conan gör en egen undersökning och hittar ett kontaktlinsfodral utanför badrumsfönstret och en tonad kontaktlins i en av blandningsskålarna. Precis som de misstänkta pressar polisen för att släppa dem går Conan in för att avslöja tricket gjordes av en synål, snöre och en ring för att skjuta igenom nålen och den enda som bär en ring är Nishitani.  Första framträdande av detektiv Tomokawa .
112	118	The Seven Mysteries of Teitan Elementary School Case	10 augusti 1998			V16 – F4 ~ 5 (154-155)	Skola sjukvård
Ayumi kom till skolan en natt för att hitta en maskerad man. Hon berättade för rektor om det och han var frånvarande de senaste två dagarna och de andra lärarna agerar misstänksamma. Detektivpojkarna smyger sig in i skolan på natten där de hittar dockor med deras namn på, skyltdockor och statyer flyttas och någon försöker skrämma dem med röd färg och torris. Detektivpojkarna låtsas vara rädda och gömmer sig i badrummet. När de kommer ut hittar de sin lärare, fru Kobayashi, som i hemlighet övar för föräldermötet. Hon påstår sig dock inte ha försökt skrämma bort dem och de inser att någon annan verkligen är i skolan. Det är dock faktiskt vice rektorn som förlorade sin tupp och hade letat efter den de senaste två nätterna.  Sumiko Kobayashis och Ryujiro Uematsus första uppträdande .
113	119	The White Sandy Beach Murder Case	17 augusti 1998			SV1 – F6	Pool flyta
Ran, Kogoro och Conan åker till en liten strandstad och de hittar en flicka död genom att drunkna. Allt pekar på att unga Mitsuko begår självmord … men hennes bästa vän Tomoko tänker annorlunda och ber Kogoro bevisa det! Den största misstänkta, Mitsukos före detta pojkvän Dr. Tanaka, har dock en mycket bra alibi. Kan Conan bryta igenom det och se vad som är hans roll i hennes död?
114	120	Scuba Diving Murder Case (del 1)	24 augusti 1998			V17 – F3 ~ 5 (163-165)	Fjäder
Ran lurar sin mor och far till att gå på stranden tillsammans. Kogoro, irriterad, åker till badrummet och återvänder med två tjejer som heter Kiwako Toda och Harumi Matsuzaki som bjuder in familjen Mouri och Conan till lunch med dykklubben på den lokala högskolan. Kiwako bestämmer sig för att snorkla ensam och ber Harumi att skaffa henne en handduk under lunchen. Efter ett tag ser gruppen att Kiwako drunknar och rusar för att rädda henne. Att drunkna är det minsta av deras bekymmer eftersom Kiwako blev biten av en orm. Ran är säker på att hon såg en erabu havsorm, men alla är förvirrade när hon hävdar att hon såg ormen med vingar.
115	121	Scuba Diving Murder Case (del 2)	31 augusti 1998			V17 – F3 ~ 5 (163-165)	Ringa
Familjen Mouri, Conan och medlemmarna i dykklubben rusar till sjukhuset där Kiwako är på intensivvård. Conan och Eri är säkra på att händelserna var ett mordförsök och Conan får en uppfattning vem som gjorde det efter ett samtal som Eri och Ran har om Kogoro. Conan slår ut Kogoro för att använda honom för att berätta avdraget han har framför Harumi. Conan tror att Kiwako bara låtsades drunkna för att testa sin fästmans kärlek till henne och Harumi tvingade en orm att bita Kiwako för att dra nytta av situationen som förklarar de vingar Ran såg. Harumi erkänner sitt misstag och är glad att motgiften nådde sjukhuset i tid för att rädda Kiwako.
116	122	Mystery Writer Disappearance Case (del 1)	7 september 1998			V19 – F2 ~ 4 (182-184)	1/2
En ung kvinna dyker upp på detektivbyrån och ber detektiv Mori att hitta sin far, en mysterieskribent, som försvann för två månader sedan tillsammans med sin fru. Den enda ledtråden till var han befinner sig är en bit som finns i hans senaste publikation, men kan Conan och de andra lösa koden?  Första utseendet på Kaori Shinmei .
117	123	Mystery Writer Disappearance Case (del 2)	14 september 1998			V19 – F2 ~ 4 (182-184)	Franska
I fortsättning från det sista fallet fortsätter sökandet efter mysterieskrivaren. Conan och de andra måste dechiffrera koden i hans text för att lösa mysteriet med hans och hans frus försvinnande för två månader sedan. Kommer Conan att kunna hjälpa dem att göra detta utan att spränga hans skydd?
118	124-125	The Naniwa Serial Murder Case (1 Hour Special)	21 september 1998			V19 – F5 ~ 8 (185-188)	Bilspegel
En seriemördare som förstör sina offer först och sedan stöter dem fast men deras plånbok till bröstet visas i Osaka. Heiji Hattori bjuder in Conan, Ran och Mouri för en turné i Osaka. Medan de är på turnén träffar de Kazuha Toyama som har följt dem sedan början för att ”Håll ett öga på Heiji från Ran”. Senare släpps deras kropp på bilen, det tredje offret för samma seriemördare. Efter att ha misslyckats med att förhindra att det fjärde offret dödades upptäckte de att offren verkligen är kopplade, de tog körprovet samtidigt på samma plats. Heiji reser sedan för att möta rådmannen Gouji, som misstänks ha orsakat morden. Conan tvingas av Ran att resa med en annan officer för att gå till deras hotell men på grund av en nödsituation körs de till platsen där Numabuchi, ett massmord och också en misstänkt, tros gömma sig. Efter att Conan hittat honom inser han att Numabuchi och Gouji inte är mördaren. Heiji inser också detta och båda räknar ut Sakada, reseguiden polisen, är mördaren. Efter att ha stoppat självmordet skjuts Heiji men överlever.  Första utseendet på Goro Otaki , Kazuha Toyama , Ginshiro Toyama och Ki’ichiro Numabuchi .
119	126	Kamen Yaiba-mordfallet	12 oktober 1998			TV Original	Modellpistol
Conan och gänget deltar i en Kamen Rider-kostymfest. Det är en duell mellan en Yaiba cosplayer och personal. Båda sköt sina vapen, men bara en kula dödade. Finns det mer i det här fallet än vad alla såg med sina egna två ögon?
120	127	Ett honungscocktailmordfall	19 oktober 1998			TV Original	Ballong
Kogoro är inbjuden till ett bergshus av en tidigare klient vid namn Hiromi Yamazaki som önskar Kogoro att hjälpa till med tillkännagivandet av en kurort. Medan Kogoro tittar ut genom fönstret faller Hiromi från andra våningen och tillkännages död. Bevis visar Hiromi attackerades av bin och sprang av misstag av balkongen, men Conan tror att det finns mer i berättelsen och gör en egen utredning. Med hjälp av en utslagen Kogoro förklarar Conan hushållerskan Shingo Aihara som mördaren som använde Hiromis apifobi till sin fördel och andra knep för att se till att Hiromi föll till hennes undergång.
121	128	The Locked Bathroom Murder Case (del 1)	26 oktober 1998			V20 – F7 ~ 9 (197-199)	Packtejp
Conan, Ran och Kogoro är på väg till en Yoko-konsert när Kogoro upptäcker att han tappade sin biljett. Han hör en kvinna som heter Masayo på telefontelefonen och hennes situation om en vän som inte kan gå till konserten på grund av förkylning. Kogoro ber henne om reservbiljetten och hon accepterar så länge Kogoro kör henne till sitt hus för att hämta sin syster. Masayo finner badrummet förseglat med tejp och när de bryter igenom hittar de Masayos syster död. Alla tror att döden var ett självmord, men Conan känner till mordet.
122	129	The Locked Bathroom Murder Case (del 2)	2 november 1998			V20 – F7 ~ 9 (197-199)	Bandana
Offrets fästman tränger in och berättar för polisen att han ringde dörrklockan dagen innan eftersom offret missade ett möte. Conan slår ut Kogoro och berättar sitt avdrag för alla att Masayo är mördaren och att det förseglade rummet inte alls var förseglat. För att bevisa det riktar Conan polisen till blodfläcken på dörren och förklarar att Masayo fick blod i huvudbandet och tittade genom spionhålet när fästmannen ringde på dörrklockan.
123	130	Kidnapping Case för Weather Girl	9 november 1998			TV Original	Piper
Aki Asano, väderflickan för de lokala nyheterna, lämnar ett meddelande för Kogoros hjälp. Kogoro är borta på grund av affärer, så Detective Boys går istället för att upptäcka att Aki har fått hotbrev. Conan ger Aki sitt personsökningsnummer precis innan hon får ett brådskande telefonsamtal och ber detektivpojkarna vänta på henne. Hon kommer inte tillbaka, men Conan börjar ta emot nummer som meddelanden från henne på sin personsökare inklusive nödtelefonnumret. Med en ledtråd från Ran och Genta kan Conan avkoda meddelandena och hitta var Aki är och gripa kidnapparen.Anmärkning: För närvarande är det sista avsnittet av den engelska versionen av dubbspråket. Funimation hade meddelat att de inte hade några aktuella planer på att dubba detektiv Conan förbi detta avsnitt och har sedan dess tappat licensrättigheterna till showen. Alla avsnitt som fortsätter detta avsnitt i kolumnen ”Int #” är internationella avsnitt som tillhandahålls av TMS.
124	131	A Mysterious Sniper Murder Case (del 1)	16 november 1998			TV Original	Strålkastare
Seiji Ishimoto, president för ett elektroniskt företag, hävdar att han har fått hotbrev och anställer Kogoro som livvakt. När en regeringsminister kommer på scenen vid banketten där de är, skjuts han och Seijis axel stirras. Conan upptäcker en man på balkongen, men han kan inte hitta honom. Kogoro tillbringar natten på Seijis hotellrum och håller vakt om mördaren återvänder. På morgonen får Kogoro ett telefonsamtal från inspektör Megure som meddelar att mannen på balkongen hittades död.
125	132	A Mysterious Sniper Murder Case (Part 2)	23 november 1998			TV Original	Fjärrkontroll
Seiji Ishimoto berättar för polisen om hotbrev efter att han kontaktats av ministerns sekreterare Tsuneaki Niikura. När alla lämnar hotellrummet gör Conan en sökning, men han avbryts av en okänd man som hittar något. Inspektör Megure ifrågasätter Kogoro om Seijis sekreterare och avslöjar att hon har ett motiv och visar en bild av sin pojkvän som Kogoro känner igen som den person han stötte på när han lämnade hotellrummet. Kogoro kallar alla till mordplatsen där han förklarar pojkvännen vara mördaren. Conan bedövar Kogoro för att avslöja Tsuneaki Niikura som den sanna mördaren som skickade hotbrev till Seiji som en avledning.
126	133	The Travelling Drama Troupe Murder Case (Part 1)	30 november 1998			TV Original	Tecken
När regissörens syster Megumi tittar på Drama-resande gruppens övningskörning finner manusförfattaren död. Bortsett från mordet finns det också en saknad skiva. Vad var mördarens avsikt att ta skivan ?!  Tamanosuke Itos och Megumi Itos första framträdande .
127	134	The Travelling Drama Troupe Murder Case (Part 2)	7 december 1998			TV Original	Manus
Conan och Megumi smyger ut under natten och följer regissören Tamanosuke till scenen. Medan han är där slås regissören i huvudet och läggs ut ur medvetandet. Dessutom hittas kassören död och verkar ha fallit till sin död i scenkällaren. En konstig anteckning lämnas både nära liket och i Tamanosukes händer. Dessutom hittades skivan i Tamanosukes rum med data borttagna och skivan kastades i papperskorgen. Kan detektivpojkarna arbeta tillsammans för att hitta mördaren?
128	135	The Black Organization: One Million Yen Robbery Case	14 december 1998			V2 – F4 ~ 7 ( ha ) (013-016)	Gin och vodka
Ett bankrån inträffar och Akemi Miyano är misstänkt. Conan undersöker och får reda på att pengarna var för att befria henne och hennes syster från den svarta organisationen. När Akemi träffar dem får hon reda på att de planerade att förråda henne och döda henne. Conan lyckas lyssna på sina döende ord och lär sig om existensen av den svarta organisationen.  Återintroduktion av Akemi Miyano (hennes tidigare utseende ) ignoreras).  Akemi Miyanos död. Conan avslöjar för henne att han verkligen är Shinichi Kudo .  Gin och Vodka dödar Akemi och får det att se ut som ett självmord.
129	136-139	Flickan från den svarta organisationen och universitetets professor Mordfall (2 timmars special)	4 januari 1999			V18 – F6 ~ V19 – F1 (176-181)	Kassettband
I Teitan Elementary School kommer en ny student och presenterar sig som Ai Haibara. Detektivpojkarna presenterar Haibara för Conan, som alltid kallas till när det finns brott. Just då går detektivpojkarna till en butik och hittar en udda man. Conan tror att mannen är Gin, som matade honom drogen som förändrade hans kropp. Conan låter av misstag glida faktumet om att hans kropp krymper på grund av ett läkemedel, även om han snabbt säger att det är ett skämt för att skydda hans identitet. På kontoret för ett tidningsföretag hålls Detective Boys som gisslan och håller på att dödas när Conan räddar dem. Efter att Conan informerat polisen tidigare förfalskas förfalskarna i fängelse och Conan får reda på att de inte är en del av organisationen. Senare får Conan besked av Haibara att hon kidnappade Agasa. När Conan går till Dr. Agasas hus, Conan får reda på att Haibara lurade honom. Haibara bor hos professorn. Haibara berättar för Conan att hon en gång besökte hans hus för att kolla om Conan dog av drogen eller inte. Hon berättar också för honom att hon skapade drogen och brukade vara medlem i Black Organization. Haibara berättar också för Conan att anledningen till att hon hatar organisationen är att hennes äldre syster dödades av organisationen eftersom Akemi misslyckades med jobbet. Haibara flydde från organisationen genom att ta henne drogen i ett självmordsförsök, och Agasa hittade henne. Conan skyller på henne för skapandet av drogerna och för livet för dem som hon indirekt dödade. Agasa tror att så länge Haibara finns, kommer hon att skapa botemedel mot sin produkt. Tyvärr förstördes uppgifterna efter hennes flykt. En del gamla data försvann dock för länge sedan, eventuellt av misstag skickad till en av Akemis gamla professorer. Professorn mördas strax efter, tyvärr, och Conan löser ärendet. Haibara är mycket upprörd över att han inte kunde hjälpa sin syster och går sönder. Efter att ha försökt komma åt disketten aktiveras ett virus och alla filer på disketten raderas.  Första utseendet på Ai Haibara .  Haibaras förflutna utforskas, liksom hennes förhållande till Akemi Miyano .     Haibara avslöjar hur hon brukade vara medlem i Black Organization och var den som skapade läkemedlet APTX 4869 .  Haibaras förhållande till Akemi diskuteras, liksom hennes historia med Black Organization.
130	140	Det otvivelaktiga stadionets hotande fall (del 1)	11 januari 1999			V19 – F9 ~ V20 – F1 (189-191)	Basebollkeps
Conan och detektivpojkarna tittar på en fotbollsmatch när någon ringer tv-stationen som täcker spelet. Den här personen kräver att 50 miljoner yen ges till honom, annars skjuter han urskillningslöst någon på läktaren.  Första utseendet på Miwako Sato , i en mindre komo-roll.
131	141	Det otvivelaktiga stadiet hotande fallet (del 2)	18 januari 1999			V19 – F9 ~ V20 – F1 (189-191)	TV-kamera
När pengarna plockas upp försöker polisen fånga honom. Det visar sig dock att den här personen har en partner på läktaren och kommer att skjuta någon såvida inte den här personen släpps. Polisen tvingas släppa honom, men Conan måste ta reda på var partnern som fortfarande är på arenan är innan han skjuter någon.
132	142	Magic Lover’s Murder Case (The Case)	25 januari 1999			V20 – F2 ~ 6 (192-196)	Skärmnamn
Sonoko inbjuder Conan och Ran att träffa en kille som är en trollkarl som hon träffade på nätet.  Kid och Toichi nämns.
133	143	Magic Lover’s Murder Case (The Suspicion)	1 februari 1999			V20 – F2 ~ 6 (192-196)	Båtsegel
Medlemmarna i lodgen bestämmer sig för att lämna Hamanos kropp orörd för att bevara brottsplatsen och dra sig tillbaka in i lodgen.
134	144	Magic Lover’s Murder Case (The Resolution)	8 februari 1999			V20 – F2 ~ 6 (192-196)	Bågpistol
Conan löste ärendet med Sonoko och avslöjade att Doi verkligen är Kaitou Kid i förklädnad.  Kid dyker upp i slutet av ärendet.