Säsong 16 sändes från 26 februari 2007 till 17 december 2007.

Lista över avsnitt 

Följande är en lista med avsnitt för säsong 16.

Jpn #	Int #	Avsnittets titel	Originalutsändning	Engelsk dub-sändning	Komplott	Manga källa	Nästa Conans tips
466	506	The Unsmashable Snowman (Part 1)	26 februari 2007			V54 – F3 ~ 5 (556-558)	Snowmans handskar
Conan berättar för Ai och Agasa om vad han hittills har lärt sig om organisationen baserat på de två senaste fallen medan de är på skidresa. Det verkar som om de kanske vet var Kir beror på att pojken berättar för någon vad han såg hända. Senare sker ett mord.
467	507	The Unsmashable Snowman (Part 2)	5 mars 2007			V54 – F3 ~ 5 (556-558)	Smak av snö
Conan lugnar Yamamura och förklarar mysteriet i fallet.
468	508	Mystiskt fall nära dammen	12 mars 2007			TV Original	Röntgen
Detektivpojkarna hittar detektiv Takagi som arbetar med ett rånfall på väg till dammen för att se den knäppande sköldpaddan som de tror övergavs av dess ägare. De hittade den riktiga ägaren men det visar sig att någon kille säger att sköldpaddan var hans och av misstag förlorade den. Conan blir misstänksam och undersöker saken vidare med Detective Boys.
469	509	Kaitou Kid and the Four Masterpieces (Del 1)	16 april 2007			V53 – F1 ~ 4 (544-547)	Förhandsmeddelande ritning
Ägaren av en målning fruktar att Kaitou Kid är ute efter hans värdefulla arbete. När det är dags för honom att slå till blir målningen stulen och manens far hittas död.  Kaitou Kid: s nästa rov görs. Inspektör Nakamori undersöker rånet.
470	510	Kaitou Kid and the Four Masterpieces (Part 2)	23 april 2007			V53 – F1 ~ 4 (544-547)	Saker du inte kan se, men som fortfarande finns
Conan tror att Kaitou Kid inte har något att göra med ärendet. Conan räknar ut tricket tack vare Takagi och avslöjar att målningen aldrig stulits. Han avslöjar att den skyldige satte upp detta för mord och försökte skylla det på Kaitou Kid. Därefter arresterades den skyldige. Senare möter Conan Kaitou Kid; han avslöjar att han var i förklädnad för att rensa sitt namn, som sedan flyr ut genom fönstret.  Kid dyker upp.
471	511	Den okontrollerbara hyrbilen!	7 maj 2007			TV Original	Motorvägsinformation
En hyrbil går utom kontroll medan Ran, Kogoro och Conan kör den. De kan inte hindra bilen från att springa, annars exploderar den.
472	512	Shinichi Kudo’s Childhood Adventure (del 1)	14 maj 2007			V55 – F6 ~ 9 (570-573)	Shinichi Kudos yngre bror
Conan påminner om ett fall för tio år sedan när Shinichi och Ran fick ett pussel som de var tvungna att lösa av en mystisk maskerad man som påstod sig vara Shinichis bror.     Conan berättar en historia om när Shinichi och Ran var på grundskolan. Några andra karaktärer visas också.
473	513	Shinichi Kudo’s Childhood Adventure (del 2)	21 maj 2007			V55 – F6 ~ 9 (570-573)	Kaitou Kid’s fadder
Conans minne av ärendet för tio år sedan fortsätter. Med hjälp av professor Agasa försöker Shinichi och Ran att lösa mysteriet som den mystiska mannen gav dem och avslöja hans identitet. Som det visar sig var den mystiska maskerade mannen den ursprungliga Kaitou Kid, som faktiskt hoppades att Shinichi skulle vända sig till Yusaku Kudo för att få hjälp.  Shinichi och Ran njuter av en stund tillsammans medan de tittar på solnedgången.     Vi ser en ung Kaito tillsammans med Toichi och lär oss att Kaito och Shinichis fäder faktiskt var generationen före dem.  Conan berättar en historia om när Shinichi och Ran var på grundskolan. Några andra karaktärer visas också.
474	514	Advokat Eri Kisakis kärlek	4 juni 2007			V55 – F10 ~ 11 (574-575)	Babyspråk
Ran tror att hennes mamma har en affär med en annan man efter att ha hittat en bild av henne med en annan kille. Hon och Conan bestämmer sig för att komma till sanningen och spionera på henne och mannen medan de är på en restaurang, men Conan räknar med att det finns mer i mannen än vad som syns.
475	515	Dålig tur Grand Prix	18 juni 2007			TV Original	Lycka till en dålig person
Kogoro tar Conan ut för att leta efter en koreansk restaurang i staden och bevittnar en träff och körning vilket resulterar i att två fotgängare skadas. Ett vittne avslöjar att han såg bilen vänta på dessa två innan han rusade i deras riktning och Conan drar slutsatsen att det var ett mordförsök.
476	516	Gentas bestämda dödsskott (del 1)	25 juni 2007			V55 – F3 ~ 5 (567-569)	Parkeringsbiljett
En gammal man skadas och pekar på Genta, som övade att sparka en fotboll i samma område. Är Genta den verkliga skyldige bakom skadan?
477	517	Gentas bestämda dödsskott (del 2)	2 juli 2007			V55 – F3 ~ 5 (567-569)	En retande präst
Med Genta som ledtråd till den gamle mans huvudskada försöker Conan lösa ärendet.
478	518	Verkliga 30 minuter	9 juli 2007			TV Original	Live TV-sändningsprogram
Ett mord inträffar i ett köpcentrum på översta våningen och alla dess kunder är tillslutna. Conan lyckas ta reda på att mordet användes för att försegla köpcentret så att människor efter den skyldige inte kan hitta honom. De hittar senare den skyldige som inte fanns på listan över misstänkta och arresterar honom.
479	519-522	Tre dagar med Heiji Hattori (2 timmars special)	16 juli 2007			V54 – F6 ~ V55 – F2 (559-566)	Tatamimatta och fönster
En munk påstår sig se en död kvinnas kropp, men när polisen kommer försvinner kroppen. Huvudmunk tror att han hallucinerar på grund av tanken på sin döda mamma. Conan och Heiji undersöker och får reda på sanningen. Var allt munken såg en illusion, eller finns det mer? Efter detta fall avslöjar Heiji för Conan att han har blivit inbjuden till en detektiv Koushien, med den bästa gymnasietektivet från norra, södra, östra och västra Japan. Heiji blev inbjuden att representera väst, och även om Kudo ursprungligen var valet för öst, gör Hakuba ett nytt utseende som representerar öst. Senare mördas en av detektiverna och ön är helt avskuren från resten av världen. Conan lyckas lösa ärendet och hjälp kommer på grund av Heiji.  Första introduktionen av Natsuki Koshimizu och Junya Tokitsu .  Ran och Kazuha stannar på ett skepp och spionerar för att se om Shinichi är på ön.     Hakuba Saguru visas i detta avsnitt
480	523	Gul Alibi	23 juli 2007			TV Original	Hemstadstidningen
En värdinna vid namn Hiroko Inoue hittas död i sitt hem och den skyldige har en alibi.
481	524	Mountain Witch’s Besticky (del 1)	30 juli 2007			V56 – F4 ~ 6 (579-581)	Kniv
Bilen går sönder medan professor Agasa och Detective Boys är ute och tvingar dem att övernatta i ett gammalt hus som ägs av en gammal dam. De träffar flera andra, men medan de sover finns en ung kvinna de träffade tidigare mördad av ett skarpt verktyg.
482	525	Mountain Witch’s bestick (del 2)	6 augusti 2007			V56 – F4 ~ 6 (579-581)	Guldfisk tank
Conan sätter ledtrådarna ihop och använder professor Agasa för att lösa fallet om Onibaba-legendmordet.
483	526	Den försvunna polisen	13 augusti 2007			TV Original	Sista tåget
Detektivpojkarna möter en kvinna som arbetar som kontordame som var på väg till polisstationen för att ge lite snacks till polisen som hjälpte henne tidigare, men när hon når polisstationen får hon veta att det inte finns någon polis som hon beskriver vilket innebar att polisen hon mötte var en falsk! Så DB får detektiv Takagi som också hjälper dem i det här fallet. Kan Conan lösa mysteriet med den här polisen som just försvann?
484	527	Whereverbouts of the Dark Photograph (del 1)	20 augusti 2007			V56 – F7 ~ 9 (582-584)	Stor mängd svett
Conan, Ai och Dr. Agasa undersöker det mörka fotografiet av Eisukes far och försöker lära sig mer om den mystiska Hondou-familjen. I processen är de involverade i ett annat fall, ett som verkar leda dem närmare informationen om den svarta organisationen.
485	528	Wherever of the Dark Photograph (del 2)	27 augusti 2007			V56 – F7 ~ 9 (582-584)	Tvättmaskin
Conan och hans kamrater lär sig att Eisukes far deltog i ett möte med män i svarta kostymer och tror att han och Eisuke kan vara en del av Black Organization.  Första introduktionen av Ethan Hondou .
486	529	Beckoning Cat från höger till vänster	3 september 2007			TV Original	Titta på urtavla
En man mördas och den enda aning är en kattstaty. Conan måste ta reda på vem som gjorde det och hur det gjordes.
487	530-531	Metropolitan Police Detective Love Story 8: The Left Hand’s Ring Finger (1 Hour Special)	15 oktober 2007			V56 – F1 ~ 3 (576-578)	Tightrope promenader
Satou har en ring på hennes vänstra ringfinger, som alla officerare tror att gavs till henne av Takagi, vilket gör dem arg på honom. Satou får ett samtal från Ran att det var ett mord. En femtiotvå år gammal mysterieförfattare mördas.
488	532-533	TV-stationens djävul (1 timmes special)	22 oktober 2007			V57 – F5 ~ 7 (591-593)	Leverans
Conan finner att en berömd rockstjärna är den skyldige bakom ett mord, men rockstjärnan har en förmåga. Kan Conan hitta bristen och fånga mördaren?
166-168	177-179	Tottori Spider Mansion Demon (1 Hour Special) (Remastered)	29 oktober 2007			V25 – F4 ~ 8 (246-250)	Rōmaji
Mouri och Heiji anställs för att lösa mordfallet i en herrgård som betraktas som spindelguden. Tydligen finns hans offer alltid hängda. Efteråt hittar de en man död. Ärendet fortsätter. Conan och Heiji undersöker vidare i ärendet. Men det verkar som om han lämnade ett varningsmeddelande till duon: Kazuha hittades hängd! Conan och Heiji arbetar tillsammans för att avslöja mördarens geniala metod. Robert är mördaren, driven av ilska och hat mot dem som inte hindrade flickan han älskade från att begå självmord. Men så småningom insåg han att hans lämnande meddelande var det som utlöste hans älskades död.  Ran och Kazuha blir nära vänner, båda kikar till och med på varandra för att ha brottälskande pojkvänner.  Heiji säger skämtsamt att Kazuha och honom kan sova nära varandra på natten om de går vilse. Kazuha tänker på detta och blir mycket generad. När Kazuha attackeras av mördaren är Heiji den första personen som springer fram till henne före någon annan och försöker sitt bästa för att rädda henne.
222-224	241-243	Och sedan fanns inga sjöjungfrur (1 timmes special) (Remastered)	5 november 2007			V28 – F6 ~ 10 (279-283)	Sjukförsäkringskort
Conan tillsammans med Heiji, Ran och Mouri besöker Mermaids Isle och letar efter Saori, som hade skickat ett brev till Heiji och Mouri och bad dem rädda henne från att dödas av en sjöjungfru, men när de försöker leta efter henne har hon blivit rapporteras saknad. Varje år på denna ö hålls en festival där tre lokalbefolkningen vinner Dungong Arrow som sägs utöva odödlighet till sin bärare. Festivalen bringas till ett katastrofalt slut när en av vinnarna hittas död hängande nerför vattenfallet. Conan och Heiji undersöker området och historien om Mermaids Grave, en skog på sjöjungfruön. De lär sig att en äldre som är över 130 år är innehavaren av pilen och chefen för festivalen. Under utredningen inträffar ytterligare två mord. Conan avslöjar för Heiji att han vet vem mördaren är och att möta honom senare, men senare faller han och Kazuha av en klippa. Conan avslöjar att mördaren är den äldste. Han avslöjar att den äldre var människor som klädde sig som henne för att fortsätta berättelsen om pilen. Heiji och Kazuha anländer till huset i tid för att bekräfta historien. Den skyldige avslöjar att hennes mamma var den tidigare äldste som dödades av de tre offren. Hon fortsatte den äldre berättelsen för sin mamma, men får reda på att hela staden visste att hon var den äldre och att hennes mor var sjöjungfruens lik. Alla stadsfolk böjer huvudet och ber om ursäkt för att inte berätta för henne tidigare när hon gråter på grund av sin skuld. Hon fortsatte den äldre berättelsen för sin mamma, men får reda på att hela staden visste att hon var den äldre och att hennes mor var sjöjungfruens lik. Alla stadsfolk böjer huvudet och ber om ursäkt för att inte berätta för henne tidigare när hon gråter på grund av sin skuld. Hon fortsatte den äldre berättelsen för sin mamma, men får reda på att hela staden visste att hon var den äldre och att hennes mamma var sjöjungfruens lik. Alla stadsfolk böjer huvudet och ber om ursäkt för att inte berätta för henne tidigare när hon gråter på grund av sin skuld.  Medan han tittade i det tidigare besökarregistret hittar Conan namnet ”Shiho Miyano” men han tvivlar på att detta var Haibara.  Kazuha blir generad när ämnet för hennes känslor för Heiji kommer upp under hennes samtal med Ran. Heiji och Kazuha finns fast på en klippa och Kazuha hänger knappt på Heiji för att överleva! Kazuha tar pilen som hon vann i tävlingen och sticker Heiji med den och hoppas att han släpper henne så att hon kan falla av och säger ”Jag ger mitt långa liv på dig.” Men Heiji vägrar att släppa taget, även när utslaget blir otroligt blodigt. Han hjälper henne att säkerhetskopiera och hjälper henne till den äldre stugan och lovar att han aldrig kommer att låta någon skada henne medan han är hos henne.
489	534-535	Rättssalen Konfrontation III: Åklagaren som ögonvittne (1 timmes special)	26 november 2007			TV Original	Jacka
I den tredje rättssalen möter Eri Kisaki en annan klient och ställs mot en ny kvinnlig konkurrerande advokat som så småningom blir väsentlig för saken.
490	536-537	Heiji Hattori vs. Shinichi Kudo: Avdragsslag på skidbacken (1 timmes special)	3 december 2007			V50 – F8 ~ V51 – F1 (518-522)	Skidlift
Heiji återupplivar ett fall från det förflutna när han berättar Conan om en detektiv som han träffade för några år sedan på en skidresa medan de gick i grundskolan. Heiji hävdar att detektivet är bättre än Shinichi. Detektivet visar sig dock inte vara någon annan än Shinichi. Förr i tiden sköts en man död när han befinner sig i en skidlift. Det hade dock varit omöjligt att skjuta honom framför eller bakom honom. Shinichi och Heiji räknar ut det samtidigt på grund av antydan från sin far. De löser ärendet samtidigt utan att träffa varandra.     Vi återvänder till ett av Heijis fall, dit vi verkligen får reda på att det faktiskt var första gången han verkligen träffade Shinichi.
S2	–	Black History (TV Special)	17 december 2007			TV Original	Ej tillämpligt
En sammanfattning av den svarta organisationens handlingar hittills, sändes före Clash of Red and Black .  Sammanfattning av de flesta viktiga fall i Black Organization  Sammanfattning av FBI: s kamp mot den svarta organisationen
309-311	334-336	Kontakt med Black Organization (1 timmes special) (Remastered)[1]	17 december 2007			V37 – F8 ~ V38 – F1 (380-383)	Myntfack
Akai känner genast igen Ran från New York-fallet och undrar varför hon gråter när han ser henne. Senare åker Conan till Agasas hem för att se disketten, som till en början verkar som en vanlig dagbok. Efter att ha uppmärksammat misstänkta tomma delar av disketten upptäcker Conan och Agasa dock att mannen verkligen har band till den svarta organisationen. Agasa och Conan går båda till mannens hus i Gunma för att undersöka och upptäcker att det är buggat på många ställen. Vodkaringer huset, lämnar ett meddelande och frågar efter programmet som mannen gjorde, och bestämmer sig för att komma ut omedelbart. Conan kan övertyga honom att träffa honom på en viss plats om några timmar för att leverera programmet. Agasa och Conan flyr, men deras däck är tomma och de plockas upp av två personer i en snygg bil. Conan märker misstänksamt att föraren inte har någon aning om hur man ska hantera bilen. Bilen stoppas av en vägspärr som upprättats av detektiv Yamamura som säger att han letar efter två bankrånare och kidnappare, som han sköt i ett fall några timmar tidigare. Conan inser äntligen vem folket är. Efter mer körning konfronterar Conan de två brottslingarna. Brottslingarna försöker fly, men Conan kan fånga dem i tid. Han försöker sedan djärvt träffa Gin och Vodka på platsen och gömmer sig i ett skåp och placerar en tracker på Vodka ’ s sko. Gin upptäcker detta och snabba förstör det. Conan passerar ut i skåpet, bara för att väckas av Haibara senare samma morgon.  Conan får Agasas nyaste uppfinning: Anywhere Ball Dispensing Belt .  Conan upptäcker en länk mellan Suguru Itakura och Black Organization. När de undersöker Itakuras hus i Gunma, förvånas Conan och Agasa av ett telefonsamtal från Vodka och ber om Itakuras program. Conan använder Itakuras röst för att ordna ett möte med honom. Han försöker sedan lura Vodka att lämna sina fingeravtryck, men fällan upptäcks av Gin, som säger till Vodka att den listiga räven som satte upp detta måste vara i närheten. Båda söker efter honom utan framgång, och Gin börjar öppna skåp och stannar vid den som Conan gömde sig i, för ”det finns inget sätt en vuxen kunde passa inuti”.

Temalåtar 

Öppningar 

• Avsnitt 466-474: Kumo ni notte av U-ka saegusa IN db
• Avsnitt 475-486: Namida nr igår av GARNET CROW
• Avsnitt 487-490: Glorious Mind av ZARD

Slut 

• Avsnitt 466-470: Shiroi yuki av Mai Kuraki
• Avsnitt 471-486: Jag tror fortfarande ~ Tameiki ~ av Yumi Shizukusa
• Avsnitt 487-490: Sekai wa mawaru to yuu keredo av GARNET CROW